Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFCAB12Q6NXP0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFCAB12Q6NXP0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms