Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRPF40BQ6NWY9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRPF40BQ6NWY9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms