Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEPROQ6NW34 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms