Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBEC3HQ6NTF7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC3HQ6NTF7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC3HQ6NTF7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms