Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LCN8Q6JVE9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LCN8Q6JVE9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms