Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC9A4Q6AI14 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A4Q6AI14 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms