Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INTS3Q68E01 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms