Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGNBP1Q5YKI7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGNBP1Q5YKI7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGNBP1Q5YKI7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GGNBP1Q5YKI7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GGNBP1Q5YKI7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GGNBP1Q5YKI7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GGNBP1Q5YKI7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GGNBP1Q5YKI7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GGNBP1Q5YKI7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GGNBP1Q5YKI7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GGNBP1Q5YKI7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GGNBP1Q5YKI7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms