Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USPL1Q5W0Q7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
USPL1Q5W0Q7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms