Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOCADQ5VW36 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOCADQ5VW36 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOCADQ5VW36 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOCADQ5VW36 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOCADQ5VW36 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOCADQ5VW36 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOCADQ5VW36 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms