Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF20Q5VT98 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF20Q5VT98 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms