Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LINC01545Q5VT33 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01545Q5VT33 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms