Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RIF1Q5UIP0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIF1Q5UIP0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIF1Q5UIP0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms