Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCP2LQ5T4T6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151 ms