Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HECTD3Q5T447 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
HECTD3Q5T447 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECTD3Q5T447 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECTD3Q5T447 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECTD3Q5T447 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECTD3Q5T447 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECTD3Q5T447 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECTD3Q5T447 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECTD3Q5T447 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECTD3Q5T447 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HECTD3Q5T447 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECTD3Q5T447 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECTD3Q5T447 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECTD3Q5T447 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECTD3Q5T447 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HECTD3Q5T447 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HECTD3Q5T447 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HECTD3Q5T447 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms