Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDZK1Q5T2W1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDZK1Q5T2W1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms