Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL5A1-AS1Q5SY13 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL5A1-AS1Q5SY13 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms