Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PERM1Q5SV97 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERM1Q5SV97 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms