Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC39AQ5SRH9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms