Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD3Q5JSP0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD3Q5JSP0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD3Q5JSP0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD3Q5JSP0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD3Q5JSP0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD3Q5JSP0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD3Q5JSP0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD3Q5JSP0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD3Q5JSP0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD3Q5JSP0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD3Q5JSP0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD3Q5JSP0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD3Q5JSP0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD3Q5JSP0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD3Q5JSP0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD3Q5JSP0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD3Q5JSP0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD3Q5JSP0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FGD3Q5JSP0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms