Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB6CQ53S08 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB6CQ53S08 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms