Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL22Q53GT1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL22Q53GT1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms