Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC39A12Q504Y0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC39A12Q504Y0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms