Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01620Q4KN68 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01620Q4KN68 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms