Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPRNQ4KMQ1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPRNQ4KMQ1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
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