Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRY2Q49AN0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
CRY2Q49AN0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRY2Q49AN0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRY2Q49AN0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRY2Q49AN0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CRY2Q49AN0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRY2Q49AN0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms