Protein–RNA interactions for Protein: Q49AM1

MTERF2, Transcription termination factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF2Q49AM1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTERF2Q49AM1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTERF2Q49AM1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms