Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SV2CQ496J9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SV2CQ496J9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SV2CQ496J9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms