Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GEN1Q17RS7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GEN1Q17RS7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
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