Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDO1Q16878 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDO1Q16878 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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