Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIST2H2ACQ16777 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIST2H2ACQ16777 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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HIST2H2ACQ16777 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
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HIST2H2ACQ16777 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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HIST2H2ACQ16777 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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HIST2H2ACQ16777 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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HIST2H2ACQ16777 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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HIST2H2ACQ16777 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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HIST2H2ACQ16777 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST2H2ACQ16777 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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