Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF9Q16594 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF9Q16594 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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