Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HLFQ16534 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HLFQ16534 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLFQ16534 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLFQ16534 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLFQ16534 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLFQ16534 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLFQ16534 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLFQ16534 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLFQ16534 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HLFQ16534 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HLFQ16534 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HLFQ16534 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HLFQ16534 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HLFQ16534 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HLFQ16534 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HLFQ16534 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HLFQ16534 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HLFQ16534 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HLFQ16534 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HLFQ16534 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HLFQ16534 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HLFQ16534 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HLFQ16534 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HLFQ16534 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HLFQ16534 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HLFQ16534 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HLFQ16534 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HLFQ16534 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HLFQ16534 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HLFQ16534 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HLFQ16534 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HLFQ16534 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HLFQ16534 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HLFQ16534 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HLFQ16534 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLFQ16534 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLFQ16534 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLFQ16534 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLFQ16534 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLFQ16534 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLFQ16534 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLFQ16534 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLFQ16534 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HLFQ16534 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLFQ16534 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLFQ16534 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLFQ16534 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLFQ16534 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLFQ16534 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLFQ16534 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLFQ16534 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLFQ16534 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HLFQ16534 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLFQ16534 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLFQ16534 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLFQ16534 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLFQ16534 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLFQ16534 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLFQ16534 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLFQ16534 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLFQ16534 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HLFQ16534 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLFQ16534 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLFQ16534 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLFQ16534 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLFQ16534 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLFQ16534 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLFQ16534 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HLFQ16534 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLFQ16534 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HLFQ16534 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HLFQ16534 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HLFQ16534 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLFQ16534 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLFQ16534 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLFQ16534 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLFQ16534 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLFQ16534 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLFQ16534 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLFQ16534 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLFQ16534 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLFQ16534 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HLFQ16534 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLFQ16534 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLFQ16534 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLFQ16534 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLFQ16534 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLFQ16534 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLFQ16534 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLFQ16534 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLFQ16534 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLFQ16534 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLFQ16534 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLFQ16534 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLFQ16534 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLFQ16534 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLFQ16534 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLFQ16534 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLFQ16534 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
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