Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPE65Q16518 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPE65Q16518 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPE65Q16518 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPE65Q16518 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RPE65Q16518 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPE65Q16518 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RPE65Q16518 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPE65Q16518 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPE65Q16518 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPE65Q16518 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPE65Q16518 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPE65Q16518 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPE65Q16518 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPE65Q16518 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPE65Q16518 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPE65Q16518 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPE65Q16518 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RPE65Q16518 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPE65Q16518 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPE65Q16518 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPE65Q16518 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPE65Q16518 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPE65Q16518 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPE65Q16518 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPE65Q16518 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RPE65Q16518 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPE65Q16518 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPE65Q16518 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPE65Q16518 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPE65Q16518 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPE65Q16518 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms