Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX2Q16385 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX2Q16385 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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