Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMA4Q16363 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMA4Q16363 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
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