Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNGA3Q16281 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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CNGA3Q16281 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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CNGA3Q16281 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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CNGA3Q16281 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGA3Q16281 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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