Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HERC1Q15751 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERC1Q15751 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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