Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SURF1Q15526 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SURF1Q15526 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SURF1Q15526 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms