Protein–RNA interactions for Protein: Q15291

RBBP5, Retinoblastoma-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP5Q15291 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RBBP5Q15291 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBBP5Q15291 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms