Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRRQ15256 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRRQ15256 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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