Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NECTIN1Q15223 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NECTIN1Q15223 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
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