Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCAPD2Q15021 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCAPD2Q15021 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCAPD2Q15021 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NCAPD2Q15021 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NCAPD2Q15021 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NCAPD2Q15021 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCAPD2Q15021 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCAPD2Q15021 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NCAPD2Q15021 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NCAPD2Q15021 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCAPD2Q15021 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCAPD2Q15021 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCAPD2Q15021 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NCAPD2Q15021 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCAPD2Q15021 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCAPD2Q15021 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NCAPD2Q15021 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCAPD2Q15021 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCAPD2Q15021 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
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