Protein–RNA interactions for Protein: Q15018

ABRAXAS2, BRISC complex subunit Abraxas 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS2Q15018 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABRAXAS2Q15018 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABRAXAS2Q15018 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABRAXAS2Q15018 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABRAXAS2Q15018 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABRAXAS2Q15018 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABRAXAS2Q15018 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABRAXAS2Q15018 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABRAXAS2Q15018 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS2Q15018 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS2Q15018 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS2Q15018 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS2Q15018 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS2Q15018 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABRAXAS2Q15018 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms