Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHD4Q14839 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
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CHD4Q14839 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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CHD4Q14839 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
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CHD4Q14839 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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CHD4Q14839 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHD4Q14839 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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CHD4Q14839 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHD4Q14839 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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