Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CBX2Q14781 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CBX2Q14781 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
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