Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMC1AQ14683 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC1AQ14683 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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