Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 ALDH1A2-202ENST00000347587 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.85e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ARPP19-212ENST00000569281 661 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.821e-11■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ARPP19-209ENST00000567669 745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.821e-11■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALDH1A2-207ENST00000558231 1664 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.835e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALDH1A2-206ENST00000558073 581 ntTSL 49.8□□□□□ -0.845e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 HDLBP-225ENST00000452931 801 ntTSL 59.7□□□□□ -0.862e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ARPP19-213ENST00000569723 550 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.891e-11■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALDH1A2-203ENST00000430119 3049 ntTSL 29.45□□□□□ -0.95e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ANKLE2-209ENST00000542374 515 ntTSL 39.32□□□□□ -0.922e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALDH1A2-217ENST00000559517 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.955e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 CRNKL1-201ENST00000377327 4370 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.042e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 WASF2-201ENST00000536657 1083 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.075e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PSMB4-203ENST00000474100 755 ntTSL 58.24□□□□□ -1.092e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 EIF4E2-202ENST00000409098 3448 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.12e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.132e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.142e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 CRNKL1-205ENST00000496549 4093 ntTSL 1 (best)7.95□□□□□ -1.142e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 EIF4E2-214ENST00000498242 1110 ntTSL 27.68□□□□□ -1.182e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.22e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 SLC35E1-201ENST00000409648 3691 ntTSL 27.33□□□□□ -1.242e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.242e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.272e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.292e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.292e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.351e-11■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 SLC35E1-207ENST00000593812 924 ntTSL 56.63□□□□□ -1.352e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.351e-11■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALDH1A2-216ENST00000559297 542 ntTSL 46.6□□□□□ -1.355e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.382e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.41e-11■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 IVNS1ABP-206ENST00000475046 1816 ntTSL 25.59□□□□□ -1.512e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.542e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ZMYM4-203ENST00000457946 6003 ntTSL 55.32□□□□□ -1.562e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.562e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.581e-11■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ARPP19-207ENST00000565288 242 ntTSL 33.65□□□□□ -1.831e-11■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ARPP19-210ENST00000567830 275 ntTSL 33.38□□□□□ -1.871e-11■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.872e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 DDX24-206ENST00000555324 810 ntTSL 1 (best)7.2□□□□□ -1.266e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 CDC37-209ENST00000591248 1377 ntTSL 515.67■□□□□ 0.12e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.66e-7■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 MGEA5-208ENST00000479811 695 ntTSL 511.82□□□□□ -0.521e-8■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 MGEA5-210ENST00000492204 519 ntTSL 26□□□□□ -1.451e-8■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.623e-7■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.082e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.464e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.014e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ANKMY2-203ENST00000447802 2599 ntTSL 28.86□□□□□ -0.994e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.376e-7■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.993e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.913e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.733e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.63e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 G3BP2-207ENST00000507133 598 ntTSL 36.37□□□□□ -1.393e-8■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 CALM2-202ENST00000409563 770 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.655e-7■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 NUCB2-213ENST00000531242 639 ntTSL 27.88□□□□□ -1.154e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 MCM3AP-202ENST00000397708 6333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.763e-7■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.464e-11■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.324e-11■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 WAC-204ENST00000375646 2176 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.534e-11■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -04e-11■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 DNAJC2-207ENST00000464253 1809 ntTSL 1 (best)9.36□□□□□ -0.914e-11■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.794e-11■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 DNAJC2-208ENST00000475065 1952 ntTSL 1 (best)2.9□□□□□ -1.954e-11■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 GSE1-205ENST00000412692 6625 ntTSL 515.12■□□□□ 0.012e-7■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.292e-7■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.342e-7■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.362e-7■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 INTS11-226ENST00000525285 579 ntTSL 415.26■□□□□ 0.033e-9■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 P4HB-215ENST00000571507 493 ntTSL 25.88□□□□□ -1.472e-10■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.894e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 DCUN1D5-210ENST00000531571 1535 ntTSL 526.65■■□□□ 1.864e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 DCUN1D5-204ENST00000527576 790 ntTSL 525.63■■□□□ 1.694e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 S100PBP-207ENST00000482212 706 ntTSL 224.28■■□□□ 1.484e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.334e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.234e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 RNH1-217ENST00000529768 1019 ntTSL 222.28■■□□□ 1.164e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.124e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 DCUN1D5-206ENST00000529076 482 ntTSL 321.85■■□□□ 1.094e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 MYL12A-212ENST00000608786 738 nt21.52■■□□□ 1.044e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 DCUN1D5-205ENST00000527779 842 ntTSL 220.84■□□□□ 0.934e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.874e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.864e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.824e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 PAFAH1B2-201ENST00000304808 821 ntTSL 1 (best)19.99■□□□□ 0.794e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.754e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 RNH1-210ENST00000525701 1794 ntTSL 519.7■□□□□ 0.744e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.734e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.724e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.684e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.644e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 DCUN1D5-202ENST00000525420 651 ntTSL 318.85■□□□□ 0.614e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.614e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 SGMS1-204ENST00000492601 625 ntTSL 1 (best)18.33■□□□□ 0.524e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.524e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.524e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 KHSRP-206ENST00000595258 672 ntTSL 518.28■□□□□ 0.524e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 KAT8-205ENST00000539683 1051 ntTSL 218.03■□□□□ 0.484e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 HAUS4-216ENST00000555040 1107 ntTSL 218■□□□□ 0.474e-6■■□□□ 14.4
PUM1Q14671 RNH1-207ENST00000524464 624 ntTSL 517.76■□□□□ 0.434e-6■■□□□ 14.4
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 169.2 ms