Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDE1CQ14123 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE1CQ14123 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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