Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP1Q13829 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP1Q13829 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
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